顺治帝去世以后，年仅八岁的康熙即位。按照大清传统，皇帝太过年幼，国家政务需由宗室亲王主政。由于顺治即位初期，多尔衮对皇权构成了极大威胁，顺治在临终前废除旧制，委托四大臣索尼、苏克萨哈、遏必隆、鳌拜共同辅政。
随着四大臣内部权势的变化，鳌拜的势力日益壮大，专横跋扈，根本不把年幼的康熙和其他三位大臣放在眼里。眼看鳌拜权倾朝野，孝庄太后为了遏制鳌拜转而笼络索尼父子，册立索尼的孙女赫舍里氏为皇后。此举改变了太宗、世祖均在蒙古科尔沁部博尔济吉特氏家族中选择皇后的传统。
选择赫舍里氏为后，三位大臣很是不满，向孝庄抗议：“满洲下人之女，岂有当皇后之理？”矛头直指索尼。孝庄早已将三位大臣看的通透，三人表面团结一致实则各怀鬼胎。孝庄驳回了三人的抗议，坚持立赫舍里氏为后。
康熙四年(公元1665年)，康熙与年仅十二岁的赫舍里氏成婚，并正式册立为皇后。康熙和赫舍里氏结婚时，都还是天真烂漫的孩子，正是这种两小无猜的情谊，他们两人的感情很稳固。两人一起度过了鳌拜专权那段坚难的日子。赫舍里氏把后宫也打理得井井有条，康熙也才有更多的精力用在朝政上。
康熙八年(公元1670年)，赫舍里氏为康熙生下一子承祜。有了孩子的赫舍里氏十分满足，但好景不长，康熙十一年(公元1672年)二月，康熙陪祖母(孝庄)在赤城汤泉休养时，年仅四岁的承祜夭折了。孩子死后，赫舍里氏很是伤心，但为了不让康熙担心，她在康熙面前总是装着一副很开心的样子。
秋天，康熙再一次陪祖母(孝庄)去遵化疗养。康熙走后，赫舍里氏便不需要再强装开心，每天闷闷不乐，最后病倒。
康熙在归途中得知皇后病重，万分焦急，但他无法抛弃祖母先赶回京城(孝庄也病重刚有好转)。后来，御医将此事告诉孝庄太后，孝庄太后知道后，让康熙先赶回宫去看望皇后。
康熙回宫后，陪了赫舍里氏一整天，赫舍里氏的病情也有了好转，两个人的感情也通过这件事变得更好了。第二年，赫舍里氏不但身体痊愈，还再次怀上了康熙的孩子。
康熙十三年(公元1674年)，赫舍里氏为康熙生下第二个儿子胤礽。孩子虽然是顺利生了下来，但赫舍里氏却耗光了她所有力气，昏迷过去就再也没有醒来，时年二十二岁。
赫舍里氏死后，康熙对皇子胤礽宠爱极深，并亲自抚养，刚满周岁时便把胤礽立为太子。
在康熙四十七年(公元1708年)，康熙含泪废太子，并大骂胤礽“生而克母”，可见多年过去，康熙的心里仍然惦记着赫舍里氏。